金百令（百令片）和金水寶都是中醫常用的中成藥，兩者在藥物組成和功效主治上大體相似，因此并無絕對的優劣之分。不過，它們在成分、主治功效、適用人群等方面存在一些差異。
一、成分區別（公開資料）
金百令（百令片）：核心成分為發酵冬蟲夏草菌粉（Cs-C-Q80），菌株源自青海玉樹，歷經36天的低氧低溫發酵（完全模擬天然冬蟲夏草的生長環境），其基因序列99%貼近天然冬蟲夏草。冬蟲夏草在中醫藥中被視為珍貴的藥材，具有極高的藥用價值。
金水寶：主要成分是發酵蟲草菌粉（Cs-4），菌株源自青海化隆縣，歷經9天26度常溫培育。蟲草也具有一定的藥用價值，但在中醫藥領域，冬蟲夏草與蟲草被視為不同的藥材，其價值和療效差異顯著，類似于藏紅花與紅花的區別。
二、功效與主治（說明書）
金百令（百令片）：具有補肺腎、益精氣的功效，臨床上主要用于治療肺腎兩虛引起的咳嗽、氣喘、腰背酸痛等癥狀，以及慢性支氣管炎等疾病的輔助治療，它適合老年人和體質較弱的人群，能夠有效改善呼吸系統疾病，減輕癌癥的癥狀，降低慢性支氣管炎、慢阻肺的發作次數。
金水寶：也具有補肺益腎的功效，主要用于治療肺腎兩虛所致的虛勞咳嗽、氣短喘促、腰膝酸軟等。它在治療慢性支氣管炎、肺氣腫等疾病方面也有一定的療效，尤其適用于因腎虛導致的腰膝酸軟、頭暈耳鳴等癥狀。