由于聯合瓣膜病變多由風濕性心臟病(RHD)引起，故其并發癥多與風濕性心臟病有關：
(1)心房纖顫(Af)：
Af是最常見的心律失常，發生率50%以上，為相對早期的并發癥，有時為首發病癥，也可為首次呼吸困難發作的誘因或體力活動受限的開始。開始房早→房速→房撲→陣發房顫(PAf)→慢性持續Af→永久性Af。
房顫影響：舒張晚期，心房收縮輔助排血功能喪失，左室充盈加依賴于舒張期的長短。①心排血量↓ 20%，心功能降一級，既Ⅱ級降為Ⅲ級。②HR↑→心室充盈期↓(舒張期縮短)→ (增大了跨瓣壓差)左房壓↑↑→呼吸困難加劇→急性肺水腫。此時應盡快滿意控制Af的心室率或恢復竇性心律至關重要。
(2)急性肺水腫：
此為嚴重并發癥，特別是在早期，右心功能還好時，常于劇烈體力活動、情緒激動、感染、妊娠分娩、并發AF或其它快速心律失常，而誘發急性肺水腫。表現為：呼吸困難;紫紺;不能平臥、端坐呼吸;咳粉紅色泡沫樣痰;雙肺布滿干濕性羅音，如不及時救治，可能致死。
(3)血栓栓塞：
巨大左房(>5.5cm);AF：CO↓為體栓塞的危險因素。來自左房→20%發生體循環栓塞;80%體循環栓塞者有AF;1/4體循環栓塞者有反復和多發;2/3體循環栓塞為：腦栓塞→偏癱失語;四肢動脈栓塞→肢體的缺血、壞死;腸系膜上動脈栓塞→小腸壞死、出血性腸炎;腎動脈栓塞→血尿;脾栓塞→脾區疼痛。右心衰右房附壁血栓和/或盆腔靜脈、下肢深靜脈血栓→肺動脈栓塞;左房大塊血栓或帶蒂血栓→堵塞二尖瓣口→猝死。
(4)心力衰竭：
為晚期并發癥 是RHD 的主要致死原因，心衰在RHD發生率占50—70%，劇烈活動、妊娠、活動風濕常常是誘發因素。
右心衰竭→右心排血量↓→肺循環血量↓→左房壓↓→呼吸困難有所下降，發生急性肺水腫和大咯血的危險減少，此為保護性作用，但其代價是心排血量降低。
(5)感染性心內膜炎：
發生率 6—10%，發生在瓣膜病的早期，晚期瓣膜鈣化或心房顫動者更少見;多見于MI、AI，單純MS少見。
贅生物的部位位于血流從高壓腔經狹窄口到低壓腔產生高速射流和湍流的下游如：MI的瓣葉心房面、AI的瓣葉的心室面、VSD的間隔右室面，以及被血流高速沖擊的心或大血管內膜處。與該處的側壓下降、內膜灌注減少有關，有利于微生物沉積、生長。
感染的細菌常見草綠色鏈球菌(口腔入)，葡萄球菌(皮膚)，腸球菌和革蘭陰桿(消化道泌尿)。一旦發生感染性心內膜炎，就可以加重心衰。
(6)呼吸道感染：
在肺淤血的基礎上，很容易出現。常見。合并細菌感染，加重心衰。 但肺淤血不利于TB的生長，不易合并肺內TB。
