一、病因
為了闡明幽門狹窄的病因和發病機理，多年來進行大量研究工作，包括病理檢查、動物模型的建立、胃腸激素的檢測、病毒分離、遺傳學研究等，但病因至今尚無定論。
1.遺傳因素
在病因學上起著很重要的作用。發病有明顯的家族性，甚至一家中母親和7個兒子同病，且在單卵雙胎比雙卵雙胎多見。雙親有幽門狹窄史的子女發病率可高達6.9%。若母親有此病史，則其子發病的概率為19%，其女為7%;父親有此病史者，則分別為5.5%和2.4%。經過研究指出幽門狹窄的遺傳機理是多基因性，既非隱性遺傳亦非伴性遺傳，而是由一個顯性基因和一個性修飾多因子構成的定向遺傳基因。這種遺傳傾向受一定的環境因素而起作用，如社會階層、飲食種類、各種季節等，發病以春秋季為高，但其相關因素不明。常見于高體重的男嬰，但與胎齡的長短無關。
2.神經功能
主要從事幽門腸肌層神經叢的研究者，發現神經節細胞直至生后2～4周才發育成熟，因此，許多學者認為神經細胞發育不良是引起幽門肌肉肥厚的機理，而否定過去幽門神經節細胞變性導致病變的學說，運用組織化學分析法測定幽門神經節細胞內酶的活性;但也有持不同意見者，觀察到幽門狹窄的神經節細胞與胎兒并無相同之處，如神經節細胞發育不良是原因，則早產兒發病應多于足月兒，然而二者并無差異。近年研究認為肽能神經的結構改變和功能不全可能是主要病因之一，通過免疫熒光技術觀察到環肌中含腦啡肽和血管活性腸肽神經纖維數量明顯減少，應用放射免疫法測定組織中P物質含量減少，由此推測這些肽類神經的變化與發病有關。
3.胃腸激素
有實驗給孕狗服用五肽胃泌素，結果所生小狗發生幽門狹窄的比例很高。并發現孕婦在懷孕末期3～4月時血清胃泌素濃度相對很高。據此認為孕婦在懷孕后期由于情緒焦慮使血清胃泌素濃度升高，并通過胎盤進入胎兒，加以胎兒的定向遺傳基因作用，引起幽門長期痙攣梗阻，幽門擴張又刺激G細胞分泌胃泌素，因而發病。但其他學者重復測定胃泌素，部分報告增高，部分卻無異常變化。即使在胃泌素升高的病例中，也不能推斷是幽門狹窄的原因還是結果，因在手術后1周有些病例胃泌素恢復到正常水平，有些反而升高。近年研究胃腸道刺激素，測定血清和胃液中前列腺素(E2和E2a)濃度，提示患兒胃液中含量明顯升高，由此提示發病機理是幽門肌層局部激素濃度增高使肌肉處于持續緊張狀態，而致發病。亦有人對血清膽囊收縮素進行研究，結果無異常變化。
4.肌肉功能性肥厚
有學者通過細致觀察研究，發現有些出生7～10天嬰兒將凝乳塊強行通過狹窄的幽門管的征象。由此認為這種機械性刺激可造成粘膜水腫增厚。另一方面也導致大腦皮層對內臟的功能失調，使幽門發生痙攣。二種因素促使幽門狹窄形成嚴重梗阻而出現癥狀。但亦有持否定意見，認為幽門痙攣首先引起幽門肌肉的功能性肥厚是不恰當的，因為肥厚的肌肉主要是環肌，況且痙攣應引起某些先期癥狀，然而在某些嘔吐發作而很早進行手術的病例中，通常發現腫塊已經形成，腫塊大小與年齡的病程長短無關。肌肉肥厚到一定的臨界值時，才表現幽門梗阻征。
5.環境因素
發病率有明顯的季節性高峰，以春秋季為主，在活檢的組織切片中發現神經節細胞周圍有白細胞浸潤。推測可能與病毒感染有關，但檢測患兒及其母親的血、糞和咽部均未能分離出柯薩奇病毒。檢測血清中和抗體亦無變化。用柯薩奇病毒感染動物亦未見病理改變，研究在繼續中。
主要病理改變是幽門肌層肥厚，尤以環肌為著，但亦同樣表現在縱肌和彈力纖維。幽門部呈橄欖形，質硬有彈性。當肌肉痙攣時則更為堅硬。一般長2～2.5cm，直徑0.5～1cm，肌層厚0.4～0.6cm，在年長兒腫塊還要大些。但大小與癥狀嚴重程度和病程長短無關。腫塊表面覆有腹膜且甚光滑，但由于血供受壓力影響而部分受阻，因此色澤顯得蒼白。環肌纖維增多且肥厚，肌肉似砂礫般堅硬，肥厚的肌層擠壓粘膜呈縱形皺襞，使管腔狹小，加以粘膜水腫，以后出現炎癥，使管腔更顯細小，在尸解標本上幽門僅能通過1mm的探針。狹細的幽門管向胃竇部移行時腔隙呈錐形逐漸變寬，肥厚的肌層則逐漸變薄，二者之間無精確的分界。但在十二指腸側界限明顯，因胃壁肌層與十二指腸肌層不相連續，肥厚的幽門腫塊突然終止且凸向十二指腸腔內，形似子宮頸樣結構。組織學檢查見肌層增生、肥厚，肌纖維排列紊亂，粘膜水腫、充血。
由于幽門梗阻，近側胃擴張，壁增厚，粘膜皺襞增多且水腫，并因胃內容物滯留，常導致粘膜炎癥和糜爛，甚至有潰瘍。
二、發病機制
幽門全層肌肉肥厚、增生，以環形肌為著，系肌纖維增粗和肌束間結締組織增生所致。肥厚的肌肉組織逐漸向正常胃壁移行，在十二指腸側，因胃壁肌層與十二指腸壁肌層不延續，所以肥厚部突然終止于十二指腸起端，使幽門呈紡錘狀腫物，長為2～3cm，直徑1.5～2cm，肌層厚達0.4～0.6cm。表面顏色蒼白而光滑，堅如軟骨。腫塊隨年齡增大。肥厚肌層將黏膜向內推壓，并形成皺褶，致使幽門管腔狹窄，造成不全梗阻。胃排空受阻使胃蠕動增強，胃壁增厚，繼發胃擴張。在十二指腸側，因胃強烈蠕動使幽門管部分被推入十二指腸球部，使十二指腸黏膜反折呈子宮頸樣。幽門梗阻后，奶汁潴留刺激胃黏膜產生充血水腫。
