一、鑒別
1.網狀組織發育不良(reticular dysgenesis) 本病非常少見，不僅淋巴樣細胞分化缺陷而且髓樣細胞分化也受阻，可能為造血障礙，因為可經骨髓移植治療;可伴多發性胃腸道閉鎖，考慮為常染色隱性遺傳。
2.常染色體隱性遺傳性SCID無淋巴細胞病(autosomal recessive SCID alymphocytosis) 約有20% SCID病人以T和B淋巴細胞共同缺乏為特征，而功能性NK細胞則能測得。此型以常染色體隱性遺傳。
3.常染色體隱性遺傳SCID 此型也為T(-)B( )，約占SCID中的10%。本病NK細胞分化存在，骨髓移植后，宿主淋巴細胞功能完全恢復。
4.腺苷脫氨酶缺陷(ADA缺陷) 腺苷脫氨酶(ADA)是嘌呤代謝途徑中的一種酶，它催化腺苷變成肌苷和脫氧腺苷(dAdo)變成脫氧肌苷。在ADA缺陷時，上述催化作用受阻。dAdo能自由擴散，被磷酸化后成為脫氧三磷酸腺苷(dATP)。后者抑制核苷酸還原酶，從而阻抑細胞分化。腺苷和dAdo又可阻抑硫-腺苷同型胱氨酸水解酶，使腺苷同型胱氨酸不能將甲基授予DNA。由于腺苷、dAdo和dATP在淋巴細胞內積聚，尤其是在發育中的T細胞內積聚，使細胞中毒。
在大多數(約85%)ADA缺陷病人，T和B細胞計數均很低，臨床征象出現較早，除嚴重感染和生長發育障礙外，近50%病人發生骨骼異常，包括肋骨軟骨交接處呈杯形和分開，以及輕度骨盆發育不良。有些病人還有神經癥狀，包括皮質盲和肌張力低下。此外，還有基膜硬化和腎功能異常。早期出現的病例，壓縮RBC中dATP值>1000ng/ml。晚期出現病例<1000ng/ml。部分ADA缺陷者無免疫缺陷表現，dATP正常或邊緣性增高。
ADA基因定位于20q13-ter，包括1089個核苷酸，分成12外顯子。已發現有4個不同位點缺乏，14個變異和5個斷裂變異。
