由于CMV不顯性感染廣泛存在，因此在解釋實驗室陽性結果時要慎重，必須結合病毒分離、血清學和細胞病理學檢查方能得以肯定診斷。傳統的實驗室檢查方法有病毒分離和補體結合試驗以及中和試驗3種。采取患兒的尿、咽洗液、痰、胃液、腦脊液或臟器活檢及尸檢組織接種于敏感細胞中，培養24h后，經特殊染色可見包涵體。出現細胞病變需幾天至2周，甚至長達6周。用補體結合試驗或中和試驗的方法檢測患兒急性期與恢復期雙份血清，二者抗體效價超過4倍以上升高，即為陽性結果，補體結合試驗效價高于1∶8時，可考慮曾受CMV的感染(活動性感染)，這些傳統的方法結果準確可靠，需要較長的時間，作出回顧性診斷。近年來已建立一些更為敏感的方法，其中最主要的有免疫熒光法、酶聯免疫法和放射免疫測定法等，今介紹幾種有助于臨床的快速早期診斷方法。
1.早期抗原(EA)測定法 在CMV感染后數小時，病毒DNA復制之前即已出現一種早期抗原，其性質尚不明確，但可作為CMV感染早期的一個指標加以檢測，使用免疫熒光或酶聯免疫法能檢出EA在血清中的水平。有人認為EA的出現不僅表示早期CMV感染，而且還可能顯示既往潛伏感染激活。
2.特異性IgM測定法 CMV感染后血清抗體首先上升的是特異性IgM，運用敏感的放射免疫或酶聯免疫法可在早期測出這種特異性的抗體反應，從而作出早期快速診斷。由于IgM不能通過胎盤，故在新生兒中測得CMV特異性IgM，即可說明是活動性感染。
3.對流免疫電泳粗篩試驗 將已知抗原(CMV)置入陰極板，待測患兒血清置陽極板，運用對流免疫電泳儀可測出血清中特異性IgM，此種方法幾小時即出結果。方法簡便，但靈敏度不甚高，僅能測出補體結合抗體調度1∶128以上的陽性血清，可用作粗篩試驗。
4.尿沉渣細胞檢測 取一滴尿沉渣，固定后染色，然后置普通光學顯微鏡下觀察，可見到特殊形態的巨細胞，其胞體增大，胞核膨脹，周圍有一“暈”環繞，類似鷹眼，胞漿及胞核中均可見嗜伊紅染的包涵體，此種細胞為CMV感染所特有。此法應多次耐心進行檢查，以提高陽性率。未查到巨細胞者不能排除CMV感染。
5.其他 周圍血象單核細胞增多，有時可有血小板減少。血生化檢查有黃疸或代謝性酸中毒和低氧血癥等。
6.B超 常伴脾、肝大。
7.X線檢查 (1)胸部X線：肺部征象的出現，早于肺部體征的出現，主要是間質性肺炎的表現，一側或雙側肺野可見小片狀陰影。可出現網狀或結節樣陰影，此種現象多發生在肺尖部，有時可有明顯的肺氣腫。
(2)顱骨X線檢查：有時可見腦室旁鈣化;出生前感染者可有小頭畸形、腦積水等。
