東山縣醫院是公立非營利性醫院，建于1938年，幾十年來，經過幾代人的不懈努力，醫院從小到大，由弱變強,實現了長足的進步和質的飛躍,已發展成為一所集醫療、科研、教學、預防、康復、保健為一體的現代化二級甲等綜合醫院，與福建醫科大學附屬第一醫院、廈門市第一醫院、廈門市第二醫院等多家三級醫院建立了緊密的醫療合作關系。醫院于2015年下半年整體搬遷至新院址，新院總投資3.4億元以上，占地123畝，建筑面積4萬平方米，設置床位400張。
醫院按照適度超前的指導思想，參考二級甲等綜合醫院標準進行規劃設計，并為今后建設三級醫院預留足夠發展空間，主要有五大特色：一是醫院整體環境優越，服務功能齊全，內置分體空調，設有先進的ICU(重癥監護室)、NICU（新生兒重癥監護室）、層流手術室、消毒供應中心、靜配中心及優質病房、單人套房、高檔套房等。二是配套功能齊全，設有中心吸引、消控室、雙回路供電系統、自備電源、停車場、15部電梯等現代化配套設施。三是配備7000多萬元的先進醫療儀器設備，其中有德國西門子64排128層螺旋CT、美國通用電氣1.5T核磁共振、彩超（東芝、飛利浦、通用電氣）、德國DR、鉬靶、全自動生化分析儀、全自動血液分析儀、全自動免疫分析儀、血凝儀、全自動糖化血紅蛋白分析儀、血氣分析儀、尿沉渣分析儀等影像檢驗設備，同時購置腹腔鏡、超聲刀、膀胱鏡、輸尿管鏡等設備，提高診療水平。四是開展導診預約服務，門診大廳和住院部設有導診服務臺，專科門診候診區設有分診服務臺，方便患者就診；同時開展預約診療服務，采取網絡、電話、自助等預約方式供患者選擇。五是設立便民服務中心，將導診、咨詢、投訴、復印、出具疾病證明、醫保蓋章、預約診療、辦理入出院手續等涉及醫院對外服務的事項整合集中一個窗口受理和辦理，實現了入、出院“一站式”服務，為患者提供了便捷的綜合服務；增設自助存款繳費、自助排隊、自助打印報告和票據等自助設備，減少取藥、候診排隊次數，縮短了患者的等候時間。
醫院現有職工395名，其中衛生技術人員325名。高級職稱9名，副高職稱22名，中級職稱78名。醫院設有臨床科室10個，內一科（神內、呼吸、腎內、感染）、內二科（消化、心內、內分泌）、外一科（神外、骨外）、外二科（普外、泌尿外、胸外）、婦產科、兒科（內設NICU）、急診科、重癥監護室、手術室、麻醉科；門診科室13個，內科門診、兒科門診、婦產科門診、外科門診、體檢中心、血液凈化室、口腔科、眼科、耳鼻喉科、皮膚科、康復科、中醫肛腸門診、中醫骨傷門診；醫技功能科室5個，放射科（CT、DR、核磁共振、鉬靶）、功能科（彩超、B超、腦電圖室、心電圖室）、檢驗科、病理科、內鏡室（胃鏡、腸鏡、氣管鏡）；同時設置120急救中心，承擔全縣120指揮調度、日常醫療急救服務和突發事件的緊急醫療救援。
目前，無論在規模、病種診治范圍、設備儀器先進程度、特色專科、科技人才結構以及單病種治愈水平等方面，都達到了一定水平，有效的解決了群眾看病難、看病貴的問題。
