一、中醫:
中醫認為尖銳濕疣發生的主要病因病機是由于房事不潔或間接觸污穢之物品，濕熱淫毒從外侵入外陰皮膚粘膜，導致肝經郁熱，氣血不和，濕熱毒邪搏結而成臊疣。由于濕毒為陰邪，其性粘滯，纏綿難去，容易耗傷正氣。正虛邪戀，以致尖銳濕疣容易復發，難以根治。 (一)房事不潔 男女婚外性生活或性濫交或多個性伴侶是導致尖銳濕疣發生的主要原因。由于不潔的性生活容易從外感受濕熱淫毒之邪。病邪由外陰皮膚粘膜侵入機體，引起肝經下焦濕熱郁阻，氣血不和。濕熱毒邪搏結聚于外陰皮膚腠理而成臊疣。(二)間接接觸污穢之物品 尖銳濕疣亦可由于外陰皮膚粘膜接觸了有病邪的污穢之物品而感染。例如有病邪的浴巾、浴缸、內衣褲、醫療用品等。(三)正虛邪戀 由于濕毒之邪為陰邪，其性粘滯，侵入機體后纏綿難去，且易耗傷正氣，以致正虛邪戀，外陰皮膚粘膜的尖銳濕疣容易復發，難以根除。
二、西醫:
西醫研究已知尖銳濕疣是由人類乳頭瘤病毒(HPV)所致。HPV是一種裸露型的DNA病毒，目前已知它的分子生物學分型有70多種，其中HPV6、HPV11、HPV16、HPV18與人類外陰生殖器尖銳濕疣關系最為密切。人類是HPV的惟一宿主，臨床主要通過直接接觸傳染，亦有小部分通過間接接觸而感染。尖銳濕疣的發病、發展和復發與細胞免疫功能低下有很大關系。由于HPV亞臨床感染和潛伏感染以及細胞免疫功能低下的原因，致使尖銳濕疣治療后極易復發。
