患者消瘦，營養不良，腹瀉，呈脂肪便。本病患者空腸粘膜上皮的絨毛及微絨毛呈明顯萎縮，粘膜表面扁平。粘膜固有層顯慢性炎性改變，有淋巴細胞、漿細胞，有時有嗜酸性粒細胞浸潤。如患者飲食不含麩質類食物，則上述腸粘膜病變可以恢復。
加到體外培養的空腸粘膜上，可見引起組織內T細胞增生。
常見的惡臭便癥狀有消瘦、腹瀉、呈脂肪便、便惡臭等，需要和下面的癥狀相互鑒別。
呈泡沫樣有腥臭味稀便：新生兒流行性腹瀉(epidemic diarrhea of newborn)是指健康搜索在產科嬰兒室或醫院新生兒病房中爆發流行的腹瀉健康搜索由于新生兒免疫功能不完善及環境因素，易發生感染健康搜索病原以細菌、病毒、真菌寄生蟲較為常見主要通過孕母產道被污染的乳品水、乳頭食具成人帶菌者等傳播扁鵲網。不同病原所致的新生兒流行性腹瀉各有一定特點： (1)大腸埃希桿菌腸炎：致病性大腸埃希桿菌腸炎大便為水樣、蛋花湯樣有腥臭味;產毒性大腸埃希桿菌腸炎大便為稀水樣;侵襲性大腸埃希桿菌腸炎大便呈黏液膿血樣勱有腥臭味勱大便量不多扁鵲網 (2)鼠傷寒沙門菌腸炎：大便性狀多變勱，可呈水樣黏凍樣、黑綠色或灰白色有明顯的腥臭味。 (3)輪狀病毒腸炎勱：起病急扁鵲網常發熱大便稀水樣扁鵲網量多健康搜索，腥臭味可不明顯。 (4)金黃色葡萄球菌腸炎：大便多為黃綠色、暗綠色、水樣，有腥臭味。 (5)真菌性腸炎：大便呈黃綠色稀水樣，或豆腐渣樣，泡沫多。
乳糜瀉：乳糜瀉以前稱非熱帶脂肪瀉(non-tropical statorrhea，celiac disease)，又稱乳糜腹瀉、麥膠引起的腸病(glutin-induced enteropathy，簡稱麥膠腸病)。
痢疾樣大便：細菌性痢疾(bacillary dysentery)，是由痢疾桿菌引起的常見急性腸道傳染病，以結腸化膿性炎癥為主要病變，有全身中毒癥狀、腹痛、腹瀉、里急后重、排膿血便等臨床表現。由于臨床表現和疾病經過不同，醫學家將痢疾分為普通型痢疾、中毒型痢疾和慢性痢疾。痢疾雖然有多種類型，對孩子生命有威脅的只有重型和中毒型。中毒型痢疾的多數孩子起病突然，高熱不退，發病初期腸道癥狀往往不明顯，有的經過一天左右時間才排出痢疾樣大便。在典型痢疾大便排出前，用肛管取便或2%鹽水灌腸，有助于早期診斷。在痢疾高峰季節，孩子突然高熱抽風，精神很弱，面色灰白。
心悸伴消瘦、腹瀉：老年人甲亢起病隱匿，與年輕人甲亢的典型癥狀不太一樣，多數以心律失常、高血壓、食欲減退、腹瀉、消瘦等心血管和胃腸道癥狀為主。因此，如果60歲老年人出現心悸、腹瀉、體重減輕但精神狀態良好的情況，要警惕甲亢來襲。
如患者飲食不含麩質類食物，則上述腸粘膜病變可以恢復。
