對于脊柱裂引起的脊髓栓系綜合征者，均適合于手術，而且提倡盡早地予以手術治療。只有手術解除脊髓栓系的因素，才能取得治愈、好轉的機會。以往不少人將脊柱裂合并尿失禁或大小便失禁以及兼有下肢癱瘓者，視為手術禁忌證，亦即認為此類嚴重病例為不治之癥。然而近20余年來積累了大量病例的臨床處理經驗，主張采取積極的手術態度，即使已有大小便失禁或下肢癱瘓者，也應爭取手術。因此，對一些重癥病例也不宜輕易放棄治療。
1.手術治療兒童多用基礎麻醉加局麻，個別采用氣管插管全麻;成人用強化麻醉加局麻，或采用硬脊膜外麻醉。均在俯臥位下手術。無論病變在頸段、胸段或腰骶段，都使用棘上直切口，以利于向脊柱裂病變節段之上與下方擴大椎板切口。
以腰骶部隱性脊柱裂合并脊髓栓系為例，棘上直切口自腰4至骶椎中部，按通常之椎板切開手術方法，分開椎旁肌肉，顯露出缺裂之椎板。再按具體病理情況進行處理。
2.手術操作步驟可先從正常部位的中線切開，然后進入畸形部位。手術操作一般按以下步驟進行，即：
（1）擴大椎板減壓，向上多切除1～2個椎板，向下至顯露出終絲。將局部存在的一切造成對硬脊膜囊、脊髓、馬尾神經牽拉、壓迫的異常骨性、軟骨及軟組織予以切除。切除增厚的黃韌帶，將外終絲切斷，但需判明終絲兩側之骶神經，切勿損傷這些神經。如果脊髓栓系為來自硬脊膜外、硬脊膜囊與脊髓的壓迫因素原因已經解除，手術即可終止，無需再切開硬脊膜探查。
（2）如見瘢痕組織、脂肪瘤或椎管內脊膜膨出囊連至脊膜囊內，必須繼續切開硬脊膜囊作深部探查，并將瘢痕切除，分離粘連，摘除囊腫，使脊髓及神經根獲得松解。如有脂肪瘤包繞脊髓與神經，尤其是脂肪與神經組織交融難分、即使在顯微鏡下也難以分出正常脊髓境界時，則只能作脂肪瘤的次全切除，避免破壞脊髓的血液循環或直接傷及脊髓與神經。若發現存在先天性皮樣囊腫或腫瘤，應盡可能地將其予以切除。
