機遇病原菌又稱之為條件致病菌，就是指通常條件下對人不發病，在一些特殊條件下能對身體發病的病菌。機遇發病的發病標準包含：1、腸道菌群失調，一切正常有益菌與寄主中間，一切正常有益菌中間存有均衡關聯。假如這類均衡被擺脫，機遇病原菌就可發現異常繁衍與發病力提高。2、當機體免疫功能減少時，一切正常有益菌進到身體組織或血液循環系統后可發病。3、一些病菌離去一切正常寄住位置，進到別的位置生長發育繁育并發病。機遇病原菌的發病標準一般只包括以上三種。
艾滋病患者進到艾滋病期以后，因為免疫功能降低很容易產生機遇性感染，在其中最普遍、最廣為人知的便是肺孢子菌肺炎。肺孢子菌歸屬于一種細菌，它感染艾滋病患者以后能夠造成病人出現慢性咳嗽、發熱，及其呼吸不暢、血氧分壓降低，比較嚴重的病人還能夠進度到呼吸衰竭，病人會由于持續的呼吸不暢造成全身多內臟器官衰退，乃至能夠造成身亡。除開肺孢子菌肺炎以外，病人還能夠出現隱球菌性腦膜炎、白念珠菌性食管炎、帶狀皰疹、巨細胞性視網膜炎等。除開感染以外，病人還能夠繼發性惡變腫瘤，比如惡性淋巴瘤、卡波西肉瘤等。
實際上人是日常生活在一個填滿病菌，病毒感染等微生物菌種的自然環境中，包含口腔，腸胃等位置，都帶有很多病菌，病毒感染，這種微生物菌種都可能變成病原菌。當人體免疫力強過病菌發病力時，身體能夠和他們和睦相處，使這種微生物菌種變成定植菌，腸胃中的病菌乃至能夠協助身體消化吸收食材，變成益生菌粉。
可是，當機體免疫能力出現降低，身體和病菌中間的均衡會遭受毀壞，使本來的定植菌，益生菌粉變成病原菌，比如腸胃定植菌在長期性應用抗生素后，會變成二重感染的病原菌，口腔時間常數的滴蟲也可能在免疫力低下時變成口腔念珠菌病的病原菌。
