許多病例通過仔細分析病史和上述檢查的初步結果，往往可以得出正確診斷。
若診斷仍不清楚，可進一步作X線唄灌腸和鋇餐檢查，和(或)直、結腸鏡檢查。如仍無明確結論，則須根據不同情況選用超聲、CT、內鏡逆行膽胰管造影(ERCP)等影象診斷方法以檢查膽、胰疾病，或進行小腸吸收功能試驗、呼氣試驗、小腸粘膜活檢以檢查小腸吸收不良。
嬰幼兒腹瀉容易與哪些疾病混淆
1.桿菌痢疾 嬰兒痢疾表現多不典型。常無膿血便，臨床呈一般腹瀉的表現,較難鑒別.應注意流行情況，常能問出接觸史。排便前常哭鬧,顯示里急后重.仔細觀察可見患兒大便頻繁，但每次量不多,有時可見水樣便糞質中混有膿血，鏡下有較多膿細胞、紅細胞和吞噬細胞。而大腸桿菌腸炎每次便量多，一部分每次可達20ml以上，大便中粘液常見，但極少稠膿，偶有少數白細胞與紅細胞，應培養鑒別。
2.嬰兒出血性腸炎 起病與大腸桿菌腸炎無異，但治療后腹瀉不止且病情加重，腹脹較重，高熱。頻繁嘔吐，重者吐咖啡樣物。大便早期呈水樣，潛血試驗陰性，以后出現典型的暗紅色果醬樣大便。脫水重，可早期出現休克。中毒癥狀重者可昏迷、驚厥。
3.“生理性腹瀉” 滲出性體質小兒可生后不久即開始排黃綠色稀便，大便次數多，但不吐，食欲好，體重增加正常。到添加輔食后大，便自然恢復正常。
防積滯傷及脾胃，戒煙酒，忌過食辛辣，以避免對胃粘膜的反復刺激，保持心情舒暢，以免情志刺激。
